En plus de ses adhérents individuels, le ME-F est aussi composé d’associations membres qui partagent avec lui la volonté de rapprocher l’Europe de ses citoyens. En 2017, le ME-F regroupe 21 Associations Nationales Membres.

Le collège des ANM compte la branche jeune du Mouvement Européen-France : Les Jeunes Européens-France.